# [ GGGenome | 2026-06-15 17:27:48 ] # database: Rhesus pre-spliced RNA, RefSeq on T2T-MMU8v2.0, D3G 26.03 (Mar, 2026) # query: TTCATTGACAACATT # count: 8 # query: AATGTTGTCAATGAA # count: 5 # name strand start end snippet snippet_pos snippet_end query sbjct align edit match mis del ins XM_001100209.5|HESX1;704551|chr2:120756730:120785319:-|prespliced::chr2:120756730-120785319(-) + 25997 26011 TTCCTATGAATTAATCCAGGCACTTGGAAGACAATTACACTCCGTGTTAATAACATTGCCAACCTTTTCCACTATGCTGCACTCCAAATACTATTGTGTTTTCATTGACAACATTCCCTATTACATATGCATATGAAAAACAGGCATTTTCATCAGAATTACTGTAATAGCATTAAGAGATTATTATTTTTTCCAATTTCTTTGGAAGAAAATTC 25897 26111 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XM_077993242.1|HESX1;704551|chr2:120756730:120785319:-|prespliced::chr2:120756730-120785319(-) + 25997 26011 TTCCTATGAATTAATCCAGGCACTTGGAAGACAATTACACTCCGTGTTAATAACATTGCCAACCTTTTCCACTATGCTGCACTCCAAATACTATTGTGTTTTCATTGACAACATTCCCTATTACATATGCATATGAAAAACAGGCATTTTCATCAGAATTACTGTAATAGCATTAAGAGATTATTATTTTTTCCAATTTCTTTGGAAGAAAATTC 25897 26111 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XM_077993243.1|HESX1;704551|chr2:120756730:120785319:-|prespliced::chr2:120756730-120785319(-) + 25997 26011 TTCCTATGAATTAATCCAGGCACTTGGAAGACAATTACACTCCGTGTTAATAACATTGCCAACCTTTTCCACTATGCTGCACTCCAAATACTATTGTGTTTTCATTGACAACATTCCCTATTACATATGCATATGAAAAACAGGCATTTTCATCAGAATTACTGTAATAGCATTAAGAGATTATTATTTTTTCCAATTTCTTTGGAAGAAAATTC 25897 26111 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XR_013417576.1|LOC144341009;144341009|chr5:157487319:157492927:+|prespliced::chr5:157487319-157492927(+) + 1835 1849 TTCAGAAATTTTGTCCTAAACTCCATTATTTTAGGAGCTGTTTCTTAAGAAAACTCTGAGCCAAGCATTCCAGAATATATTATCGCTTTGAACACAGATTTTCATTGACAACATTTTGTGGGCATCCATTTAATATTAATATTAAGCCAAGGAAATAATGGTCCTTGTTTCTTTCCTTTAAAATGACAGGAATAGTGGGTACTTGTTCCTTCTGA 1735 1949 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XM_015139652.3|F11;702117|chr5:194688745:194715844:+|prespliced::chr5:194688745-194715844(+) + 12201 12215 CAGGCTGGTCTAGAACTGCTGGCCTCAAGCAATCCATCGGCCGTGGCCTCCCACAGTGCAGGGATTACAAGCCTGAGCCACCATGCCCAGCTTGCTATTCTTCATTGACAACATTCACTTAAACAAACAAACATCCATAAAATTAAGTCAGTTTTAAAACCTAGCTTGTATATATCTTTGAATTGGAACTCTCAGAGCCTTCAGCACTTGCTTGA 12101 12315 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XM_015139653.3|F11;702117|chr5:194688745:194715844:+|prespliced::chr5:194688745-194715844(+) + 12201 12215 CAGGCTGGTCTAGAACTGCTGGCCTCAAGCAATCCATCGGCCGTGGCCTCCCACAGTGCAGGGATTACAAGCCTGAGCCACCATGCCCAGCTTGCTATTCTTCATTGACAACATTCACTTAAACAAACAAACATCCATAAAATTAAGTCAGTTTTAAAACCTAGCTTGTATATATCTTTGAATTGGAACTCTCAGAGCCTTCAGCACTTGCTTGA 12101 12315 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XM_077969621.1|COX10;718301|chr16:15168647:15726222:+|prespliced::chr16:15168647-15726222(+) + 444633 444647 AAGCTCTGTTGGTTTGGGAATATTACTCTCCTATGGGCTCCCAGAGCTATTTCTGGGCCTGCAGTGCAGTGCCTCTGGGCCTATATTAGATGGGCCATGCTTCATTGACAACATTGATTTTATGTTTATTTGTGAAAGGGCAGAATATGAGATTACCAAATAAAATATAATTTCAGGTGTTATTAATGAGGGAGTATATTGCATTCACTTTTAAT 444533 444747 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_001194644.2|COX10;718301|chr16:15586005:15726222:+|prespliced::chr16:15586005-15726222(+) + 27275 27289 AAGCTCTGTTGGTTTGGGAATATTACTCTCCTATGGGCTCCCAGAGCTATTTCTGGGCCTGCAGTGCAGTGCCTCTGGGCCTATATTAGATGGGCCATGCTTCATTGACAACATTGATTTTATGTTTATTTGTGAAAGGGCAGAATATGAGATTACCAAATAAAATATAATTTCAGGTGTTATTAATGAGGGAGTATATTGCATTCACTTTTAAT 27175 27389 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 XM_001084620.4|SYT1;695390|chr11:86057410:86651827:+|prespliced::chr11:86057410-86651827(+) - 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